256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11160 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11160  predicted protein  100 
 
 		 433 aa  862    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.882711  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9233  predicted protein  50.82 
 
 		 353 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000123745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  29.22 
 
 		 446 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  29.63 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  26.13 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  24.68 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  26.4 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  25.33 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  23.06 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  25.07 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  24.8 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  25 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  23.59 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  24.94 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  23.31 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  23.59 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  22.49 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  24.37 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  25.32 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.77 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.77 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  23.26 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  30.69 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  25.99 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 745 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 786 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  24.58 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  24.65 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.23 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  24.37 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  23.58 
 
 		 482 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  26.03 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  24.3 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  21.77 
 
 		 651 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.81 
 
 		 485 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 		 474 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  25.83 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  23.36 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  22.73 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 		 516 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  25.28 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  25.28 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  25.12 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  22.73 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  20.83 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  24.65 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  25.28 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  24.65 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  25.28 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  24.65 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  23.05 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.57 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  27.14 
 
 		 509 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 764 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.8 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  21.93 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  22.8 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  22.8 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  22.74 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  22.8 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  22.74 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>