More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11151 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11151  predicted protein  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  228  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.93 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 290 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  39.37 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  40.2 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  41.31 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  37.07 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>