69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11145 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  100 
 
 
325 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  33.72 
 
 
651 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  38.67 
 
 
291 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  34.41 
 
 
547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10029  predicted protein  38.38 
 
 
109 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  21.72 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  27.51 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42021  predicted protein  23.4 
 
 
533 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  20.79 
 
 
516 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  22.49 
 
 
552 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  21.21 
 
 
615 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  24.78 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
104 aa  55.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25246  predicted protein  32.63 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132508 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04398  G-patch DNA repair protein (Drt111), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06840)  31.96 
 
 
523 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35 
 
 
82 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30.1 
 
 
116 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  25.41 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29530  predicted protein  36.27 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145211  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  25.27 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
115 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 
157 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  24.62 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  26.19 
 
 
125 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
98 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  34.38 
 
 
819 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  27.71 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  33.33 
 
 
122 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  27.21 
 
 
838 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  32.61 
 
 
129 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  32.61 
 
 
128 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  26.28 
 
 
143 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  31.71 
 
 
107 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
102 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
102 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
122 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  25.25 
 
 
453 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  28.57 
 
 
112 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  23.66 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  30.67 
 
 
134 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  23.83 
 
 
690 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  24.19 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26750  predicted protein  28.57 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  31.82 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  28.92 
 
 
107 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  28.75 
 
 
97 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
101 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  29.41 
 
 
95 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  29.41 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
150 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
108 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  24.1 
 
 
182 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
103 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  28.92 
 
 
184 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  30.43 
 
 
124 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.3 
 
 
202 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  26.14 
 
 
97 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
480 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 
132 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  27.78 
 
 
125 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  29.63 
 
 
128 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  33.33 
 
 
559 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>