More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11088 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03702  leucyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_6G12630)  37.98 
 
 		 1062 aa  699    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01290  leucine-tRNA ligase, putative  40.07 
 
 		 1114 aa  756    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77997  cytosolic leucyl tRNA synthetase  37.47 
 
 		 1093 aa  710    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.180123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31093  predicted protein  43.74 
 
 		 1094 aa  886    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00463574  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11088  predicted protein  100 
 
 		 1086 aa  2271    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0568  leucyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 977 aa  480  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0802  leucyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 950 aa  412  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1356  leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 962 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0187  leucyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 955 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1724  leucyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 955 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.559685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2048  leucyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 966 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0879  leucyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 955 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1575  leucyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 952 aa  376  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2008  leucyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 925 aa  364  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.374206  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1960  leucyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 983 aa  361  4e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0691  leucyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 946 aa  360  9e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000845004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1924  leucyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 926 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2923  leucyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 924 aa  357  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398317  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0203  leucyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 945 aa  356  1e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1469  leucyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 939 aa  354  5e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.049577  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0260  leucyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 945 aa  352  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76888  normal  0.0524168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1246  leucyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 945 aa  350  7e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1654  leucyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 944 aa  341  4e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0233  leucyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 969 aa  332  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0367  leucyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 955 aa  328  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1404  leucyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 932 aa  325  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0690  leucyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 926 aa  322  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.909787  normal  0.143795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1940  leucyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 938 aa  320  6e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0573  leucyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 938 aa  307  6e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1485  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  23.42 
 
 		 934 aa  197  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0255896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 882 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  22.06 
 
 		 904 aa  79.7  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  21.15 
 
 		 906 aa  79.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1197  leucyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3295  leucyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 		 971 aa  77  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  23.66 
 
 		 930 aa  72.4  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 818 aa  72  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 933 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 933 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 824 aa  70.1  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 858 aa  69.7  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 834 aa  69.7  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 877 aa  68.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 882 aa  68.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0104  leucyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  22.07 
 
 		 826 aa  67.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 819 aa  67.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 859 aa  67.4  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  23.69 
 
 		 823 aa  67.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 868 aa  67  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 874 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 874 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 874 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1095  leucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 877 aa  66.6  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768167  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 877 aa  66.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 820 aa  66.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1740  leucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.723566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 871 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 829 aa  65.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  22.31 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 824 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 872 aa  65.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  23.51 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 886 aa  65.1  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3924  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.505151 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 886 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  64.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09000  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 870 aa  64.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 805 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  21.61 
 
 		 869 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 877 aa  64.7  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 805 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4250  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 876 aa  64.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.440973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4381  leucyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 876 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 886 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 859 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 817 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 887 aa  63.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0171  leucyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 874 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 906 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  21.72 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 868 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 864 aa  63.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 863 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>