18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11048 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_11048  predicted protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  37.5 
 
 
241 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  32.14 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  32.8 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  33.61 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  32.26 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  30.95 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  30.66 
 
 
151 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  31.9 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  31.9 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  25.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  26.67 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  27.82 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  25.58 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.561031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>