More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11021 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_11021  predicted protein  100 
 
 
323 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  62.81 
 
 
325 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  62.81 
 
 
325 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  62.81 
 
 
325 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  61.88 
 
 
325 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  62.81 
 
 
325 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  62.81 
 
 
325 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  62.81 
 
 
325 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  63.12 
 
 
325 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  62.19 
 
 
325 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  62.19 
 
 
325 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  62.19 
 
 
325 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  61.25 
 
 
325 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  61.37 
 
 
325 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  62.46 
 
 
325 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1787  transketolase, central region  61.83 
 
 
325 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  60.44 
 
 
325 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  60.62 
 
 
325 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  60.44 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  59.69 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  58.86 
 
 
325 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  59.19 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08559  hypothetical protein similar to 2-oxo acid dehydrogenase, E1 component beta subunit (Eurofung)  58.51 
 
 
386 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.379742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  57.19 
 
 
324 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  57.19 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  57.19 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  55 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03850  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), putative  49.4 
 
 
447 aa  317  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  46.61 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  47.34 
 
 
346 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  47.34 
 
 
346 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.86 
 
 
337 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  47.34 
 
 
346 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.63 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  48.37 
 
 
339 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  46.59 
 
 
337 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 
351 aa  298  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  47.04 
 
 
347 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  47.04 
 
 
347 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  46.15 
 
 
337 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.11 
 
 
336 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3236  Transketolase central region  47.98 
 
 
324 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3743  transketolase central region  48.49 
 
 
352 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  49.84 
 
 
340 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.56 
 
 
337 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.56 
 
 
337 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  48.8 
 
 
352 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  46.59 
 
 
350 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  48.49 
 
 
352 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  46.59 
 
 
350 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.19 
 
 
352 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.29 
 
 
341 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  48.6 
 
 
324 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  46.88 
 
 
337 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  50.47 
 
 
322 aa  291  8e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  48.45 
 
 
346 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  45.56 
 
 
345 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  47.02 
 
 
332 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  45.65 
 
 
342 aa  289  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  45.4 
 
 
343 aa  288  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  47.35 
 
 
324 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  46.13 
 
 
332 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.29 
 
 
337 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.29 
 
 
347 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  46.27 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.56 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  47.66 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  45.17 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.99 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.73 
 
 
330 aa  281  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  46.89 
 
 
320 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.86 
 
 
325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  45.1 
 
 
337 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.55 
 
 
325 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.24 
 
 
325 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  44.58 
 
 
332 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  43.61 
 
 
325 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.48 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  44.73 
 
 
327 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  44.72 
 
 
328 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  43.12 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  43.57 
 
 
320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  46.13 
 
 
336 aa  272  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  42.24 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  42.24 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  48.54 
 
 
326 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  42.55 
 
 
324 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  41.43 
 
 
325 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>