More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11009 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  100 
 
 		 535 aa  1097    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  42.05 
 
 		 1901 aa  413  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  41.2 
 
 		 1848 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  41.34 
 
 		 1769 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  39.64 
 
 		 1904 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.15 
 
 		 1077 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.64 
 
 		 1087 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.7 
 
 		 1125 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  31.89 
 
 		 1181 aa  261  3e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.51 
 
 		 1250 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  31.86 
 
 		 1193 aa  259  9e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.71 
 
 		 1134 aa  259  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1082 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 1091 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.35 
 
 		 1068 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 1155 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 1112 aa  256  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.23 
 
 		 1071 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 1139 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 		 1104 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  34.54 
 
 		 1112 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.08 
 
 		 914 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.4 
 
 		 1102 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.2 
 
 		 977 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.33 
 
 		 918 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.77 
 
 		 1091 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.41 
 
 		 1161 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 1068 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.67 
 
 		 1100 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 1113 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  32.08 
 
 		 1113 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 1069 aa  250  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.33 
 
 		 1086 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 1261 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.64 
 
 		 1178 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 1068 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  33.21 
 
 		 872 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  33.65 
 
 		 1150 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 		 876 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  29.24 
 
 		 959 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.02 
 
 		 1067 aa  248  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.53 
 
 		 1062 aa  248  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.96 
 
 		 1068 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 1021 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  33.78 
 
 		 1142 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.4 
 
 		 991 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  31.55 
 
 		 964 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.15 
 
 		 1082 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 1090 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 1110 aa  243  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  31.84 
 
 		 1023 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 1055 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1089 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.55 
 
 		 985 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  29.42 
 
 		 1084 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  29.24 
 
 		 1084 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 		 982 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  30.98 
 
 		 1431 aa  237  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  31.59 
 
 		 1069 aa  237  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.14 
 
 		 1080 aa  237  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  30.57 
 
 		 956 aa  236  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  30.59 
 
 		 1222 aa  236  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.59 
 
 		 773 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  31.39 
 
 		 1093 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.36 
 
 		 1110 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 1357 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  33.27 
 
 		 1120 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  31.78 
 
 		 896 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  30.75 
 
 		 1064 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 1073 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  33.46 
 
 		 1120 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.38 
 
 		 1064 aa  233  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 1073 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.75 
 
 		 1064 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  30.15 
 
 		 1096 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.75 
 
 		 1064 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  30.81 
 
 		 1127 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  31.18 
 
 		 1164 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  30.02 
 
 		 1073 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.47 
 
 		 1111 aa  232  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 1066 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.38 
 
 		 1064 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  30.58 
 
 		 995 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.38 
 
 		 1064 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.42 
 
 		 1031 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 950 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.38 
 
 		 1064 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  33.27 
 
 		 1126 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.01 
 
 		 663 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 1073 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1088 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1129 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  30.38 
 
 		 1064 aa  230  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 1108 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  30.06 
 
 		 1070 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1088 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.25 
 
 		 1130 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.2 
 
 		 1084 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.83 
 
 		 1069 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.83 
 
 		 1069 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>