More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10902 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10902  predicted protein  100 
 
 		 473 aa  980    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  37.98 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  38.41 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  35.53 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  36.02 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  35.11 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  35.79 
 
 		 440 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  35.38 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  35.46 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  34.47 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  34.26 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  34.54 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  35.18 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  34.39 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  35.18 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  34.67 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  34.26 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  35.32 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  35.32 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  35.32 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  34.47 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  36.17 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  34.54 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  35.64 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  35.24 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  34.75 
 
 		 439 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  34.75 
 
 		 439 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  34.87 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  33.89 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  33.89 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  35.24 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  34.46 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  34.54 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  33.68 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  34.53 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  33.68 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  34.33 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  34.54 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  34.33 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  33.4 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  34.76 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  33.76 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  34.12 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  35.1 
 
 		 439 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  34.12 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  34.12 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  34.12 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  33.9 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  34.18 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  35.67 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  33.47 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  34.18 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  34.18 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  33.05 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  33.47 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44492  predicted protein  44.71 
 
 		 481 aa  239  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  32.84 
 
 		 448 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  34.39 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  33.26 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  33.26 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  34.39 
 
 		 459 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  33.26 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  34.39 
 
 		 459 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  33.26 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  34.61 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  33.97 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  33.76 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  33.97 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  32.85 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  33.97 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  33.97 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  33.76 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  33.76 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  33.76 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  33.26 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  35.38 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  35.38 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  33.47 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  33.47 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  33.97 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  33.55 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  33.47 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  33.05 
 
 		 446 aa  232  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  34.39 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  32.01 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  31.92 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  32.48 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>