More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10847 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  48.76 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  48.21 
 
 		 390 aa  288  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  49.29 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  49.29 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.23 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 343 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  48.06 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  49.65 
 
 		 386 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  49.3 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  49.3 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  48.93 
 
 		 369 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  49.65 
 
 		 363 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  48.59 
 
 		 369 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  49.3 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 307 aa  275  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  47.89 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  44.04 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  44.04 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  43.8 
 
 		 339 aa  228  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.37 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  41.88 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  39.48 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  40.14 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  38.64 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  35.38 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  36.75 
 
 		 424 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  36.07 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  38.81 
 
 		 481 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  35.55 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  35.55 
 
 		 465 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  35.48 
 
 		 416 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  34.15 
 
 		 408 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  34.77 
 
 		 401 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  34.41 
 
 		 401 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  34.41 
 
 		 404 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 491 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  33.83 
 
 		 487 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  32.6 
 
 		 515 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  32.23 
 
 		 492 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 485 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  33.46 
 
 		 480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  33.09 
 
 		 496 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.46 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 490 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 493 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  33.09 
 
 		 500 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  32.09 
 
 		 485 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 488 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  32.23 
 
 		 485 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  32.21 
 
 		 495 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  32.72 
 
 		 705 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  32.96 
 
 		 491 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 492 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.09 
 
 		 397 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  31.93 
 
 		 493 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  32.21 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  32.34 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  32.96 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  32.34 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  32.34 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  32.82 
 
 		 490 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.47 
 
 		 411 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  33.83 
 
 		 500 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  31.2 
 
 		 488 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  32.34 
 
 		 487 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  31.48 
 
 		 493 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  32.21 
 
 		 488 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  31.97 
 
 		 492 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  31.97 
 
 		 496 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  34.15 
 
 		 678 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.79 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 388 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 599 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  32.12 
 
 		 499 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  29.37 
 
 		 427 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  31.34 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  34.43 
 
 		 400 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  31.56 
 
 		 418 aa  135  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 505 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 493 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  31.7 
 
 		 403 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  31.54 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 579 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 672 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  32.84 
 
 		 611 aa  132  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.54 
 
 		 661 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  29.43 
 
 		 586 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  31.32 
 
 		 573 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 507 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  31.08 
 
 		 644 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.64 
 
 		 736 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 587 aa  128  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  29.93 
 
 		 529 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>