More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10824 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  100 
 
 
304 aa  642    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  45.13 
 
 
365 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  40.65 
 
 
377 aa  255  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  39.16 
 
 
377 aa  253  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  41.22 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  39.42 
 
 
343 aa  232  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
275 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
282 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
286 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 
280 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
278 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
283 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
382 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  25.82 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.77 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.5 
 
 
280 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
328 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.4 
 
 
392 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.18 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  33.55 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  27.27 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  29.38 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.13 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.68 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.11 
 
 
559 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.79 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
261 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  26.41 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.64 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  29.17 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  39.13 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.87 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  38.68 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  28.49 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  29.09 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.67 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
572 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  26.83 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.41 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  32 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
1012 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.81 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  25.69 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.17 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  35.83 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.75 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  21.98 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  31.37 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.29 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.6 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  28.26 
 
 
168 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  29.17 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
220 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
243 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
243 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
243 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
246 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.18 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  34.95 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
226 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
241 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.18 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  31.28 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28 
 
 
241 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  29.17 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
223 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.31 
 
 
386 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
239 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  28 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>