248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10674 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  38.33 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  34.56 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  31.88 
 
 
386 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.59 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.49 
 
 
302 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  33.49 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.11 
 
 
307 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  30.94 
 
 
334 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.94 
 
 
332 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  31.85 
 
 
353 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  32.26 
 
 
354 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  32.16 
 
 
332 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.24 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  30.14 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.42 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.33 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.6 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.83 
 
 
347 aa  96.3  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.44 
 
 
321 aa  95.9  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.77 
 
 
357 aa  95.5  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.66 
 
 
345 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.29 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.31 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.8 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.91 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.76 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  32.55 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.64 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.64 
 
 
331 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  27.49 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  32.02 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.25 
 
 
350 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  28.91 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  29.25 
 
 
350 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  32.24 
 
 
351 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.16 
 
 
350 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  30.99 
 
 
346 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.99 
 
 
346 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.99 
 
 
346 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  27.5 
 
 
344 aa  89  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.75 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  25.69 
 
 
362 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.08 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.29 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.66 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.42 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.44 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.9 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  31.28 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.57 
 
 
342 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.15 
 
 
354 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  29.49 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.7 
 
 
327 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  27.51 
 
 
346 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.46 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  30.29 
 
 
346 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.7 
 
 
353 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.33 
 
 
342 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  29.09 
 
 
320 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.96 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.53 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  26.19 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  29.15 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  29.33 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.23 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.64 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.88 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  29.72 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  32.02 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  27.51 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.22 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.22 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  27.19 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.91 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  27.53 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  31.28 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.65 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  24.3 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  31.31 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.77 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  26.47 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  26.13 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  26.47 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  27.3 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  29.47 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.93 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.97 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  25.93 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  28.1 
 
 
346 aa  79  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  30.5 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  23.96 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.69 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.5 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  31.25 
 
 
817 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  25.49 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  29.57 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.6 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.15 
 
 
378 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.82 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>