More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10151 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  100 
 
 
1127 aa  2292    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  46.45 
 
 
1416 aa  1003    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  34.11 
 
 
1168 aa  612  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.57 
 
 
1396 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.43 
 
 
1535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  33.45 
 
 
1135 aa  564  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  31.81 
 
 
1256 aa  558  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  32.9 
 
 
1317 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  32.06 
 
 
1549 aa  533  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  29.26 
 
 
1636 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.28 
 
 
1157 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  31.1 
 
 
1248 aa  497  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  31.24 
 
 
1513 aa  483  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  29.33 
 
 
1667 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  30.21 
 
 
1573 aa  476  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.73 
 
 
1367 aa  471  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.68 
 
 
1507 aa  464  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  28.7 
 
 
1549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  28.65 
 
 
1423 aa  452  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  30.78 
 
 
1381 aa  452  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.71 
 
 
1669 aa  436  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  33.22 
 
 
1458 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.94 
 
 
1623 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.86 
 
 
1705 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  29.48 
 
 
1607 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  29.2 
 
 
1351 aa  403  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.1 
 
 
1514 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.51 
 
 
1463 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.64 
 
 
1456 aa  380  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  27.22 
 
 
1611 aa  341  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  27.23 
 
 
1557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  37.92 
 
 
1640 aa  327  8.000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  37.62 
 
 
1587 aa  319  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  26.58 
 
 
1562 aa  318  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.02 
 
 
1115 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.07 
 
 
1659 aa  265  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.13 
 
 
1773 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  32.62 
 
 
663 aa  191  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  30.45 
 
 
594 aa  189  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  31.51 
 
 
605 aa  187  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.83 
 
 
597 aa  184  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.83 
 
 
597 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.06 
 
 
666 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  29.23 
 
 
607 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  31.34 
 
 
669 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  30.87 
 
 
680 aa  177  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.94 
 
 
640 aa  177  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.37 
 
 
672 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  31.45 
 
 
811 aa  177  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.45 
 
 
617 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
733 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  30.1 
 
 
652 aa  175  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
594 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.66 
 
 
592 aa  174  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  30.59 
 
 
634 aa  174  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  27.86 
 
 
613 aa  174  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.68 
 
 
581 aa  174  9e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  31.58 
 
 
672 aa  174  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  31.28 
 
 
649 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  30.47 
 
 
631 aa  174  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  28.72 
 
 
620 aa  172  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 
622 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  29.54 
 
 
600 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.27 
 
 
677 aa  172  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  31.73 
 
 
701 aa  171  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  30.27 
 
 
631 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  28.25 
 
 
592 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  29.49 
 
 
661 aa  170  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  28.95 
 
 
765 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.92 
 
 
593 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
593 aa  170  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.92 
 
 
593 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.92 
 
 
593 aa  170  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  30.92 
 
 
593 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.92 
 
 
593 aa  170  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.92 
 
 
593 aa  170  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.02 
 
 
598 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.57 
 
 
593 aa  168  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  29.66 
 
 
592 aa  168  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  29.98 
 
 
653 aa  168  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  30.14 
 
 
631 aa  168  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  30.14 
 
 
631 aa  168  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  29.12 
 
 
606 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  29.51 
 
 
620 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.32 
 
 
593 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.35 
 
 
721 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.54 
 
 
587 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.75 
 
 
587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  30 
 
 
691 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.48 
 
 
594 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.27 
 
 
589 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  32.49 
 
 
665 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 
592 aa  166  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  29.42 
 
 
650 aa  166  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
630 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  31.41 
 
 
613 aa  165  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 
587 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 
587 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.96 
 
 
591 aa  165  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.04 
 
 
593 aa  165  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>