30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10122 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_10122  predicted protein  100 
 
 		 324 aa  678    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195576  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06890  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  38.27 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.398405  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41266  predicted protein  38.66 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0574303  normal  0.0646612 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07145  Pre-mRNA-splicing factor slt11 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AX35]  42.14 
 
 		 377 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46506  predicted protein  39.29 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25279 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56179  predicted protein  28.93 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  31.25 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02245  Pre-mRNA-splicing factor cwc2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BB35]  28.76 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  30.36 
 
 		 769 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02720  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  30.07 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28805  predicted protein  28.12 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00434726  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  34.38 
 
 		 434 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  33.87 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  34.94 
 
 		 99 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  32.18 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  31.25 
 
 		 122 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  37.5 
 
 		 153 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 		 103 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  38.81 
 
 		 90 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  33.71 
 
 		 161 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  30.16 
 
 		 477 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  37.1 
 
 		 98 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.31 
 
 		 95 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  32.41 
 
 		 605 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  34.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>