45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2226 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1518    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 716 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 719 aa  264  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 730 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 756 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.62 
 
 		 1058 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 789 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 902 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 955 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1081 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 775 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.68 
 
 		 800 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1041 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 735 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 792 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 814 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 918 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  32.48 
 
 		 381 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 833 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 958 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 793 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 986 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 975 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  22.54 
 
 		 872 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.2 
 
 		 779 aa  47.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  23.21 
 
 		 827 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 831 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  31.13 
 
 		 831 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 854 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1019 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1036 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 792 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 759 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 787 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1034 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 988 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  29.32 
 
 		 841 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 848 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1004 aa  44.3  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1038 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1063 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1021 aa  43.9  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>