More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2109 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
647 aa  1313    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.27 
 
 
204 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.19 
 
 
203 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.24 
 
 
212 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.84 
 
 
212 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.13 
 
 
207 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  31.77 
 
 
478 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.81 
 
 
479 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  29.02 
 
 
479 aa  154  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.23 
 
 
513 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
350 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.58 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.64 
 
 
353 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0119  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.68 
 
 
210 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 
365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
351 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1601  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
251 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.02 
 
 
379 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  25.3 
 
 
526 aa  130  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.57 
 
 
351 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  25.96 
 
 
488 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  26.28 
 
 
488 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.07 
 
 
206 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.16 
 
 
343 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.38 
 
 
211 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.29 
 
 
343 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.54 
 
 
209 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  24.31 
 
 
529 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2468  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
268 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0623  Phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
255 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.23 
 
 
347 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.41 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.43 
 
 
207 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.99 
 
 
343 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.12 
 
 
352 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.55 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.63 
 
 
206 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.95 
 
 
213 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45 
 
 
208 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
207 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
207 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.8 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  35.59 
 
 
217 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0241  phosphomethylpyrimidine kinase  30.63 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
218 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
368 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.27 
 
 
221 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.22 
 
 
560 aa  111  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  25.26 
 
 
525 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.21 
 
 
205 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.81 
 
 
360 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
216 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.87 
 
 
346 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.34 
 
 
210 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
206 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.33 
 
 
216 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
203 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.59 
 
 
500 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.36 
 
 
492 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 
352 aa  108  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.78 
 
 
211 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.88 
 
 
206 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.48 
 
 
207 aa  107  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.58 
 
 
207 aa  107  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
204 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
211 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.42 
 
 
214 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.03 
 
 
204 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.58 
 
 
223 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
202 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.27 
 
 
219 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.1 
 
 
352 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.42 
 
 
223 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  24.55 
 
 
530 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.89 
 
 
224 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.89 
 
 
219 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.85 
 
 
565 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.27 
 
 
219 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
223 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.85 
 
 
217 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.08 
 
 
205 aa  103  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.84 
 
 
217 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.85 
 
 
565 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
219 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.67 
 
 
222 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
214 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
219 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.15 
 
 
214 aa  102  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 
497 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.18 
 
 
213 aa  101  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
222 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
222 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.7 
 
 
265 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>