137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2091 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  41.82 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  37.27 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  45.71 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  40 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  43.4 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  43.4 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  39.82 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  38.53 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  41.58 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  37.86 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  36.61 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  39.81 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  37.62 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  36.45 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  39.05 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  35.58 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  39.42 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  33.62 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  34.26 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  33.94 
 
 		 120 aa  66.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  34.62 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  35.96 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  34.26 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  34.91 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.65 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  38.61 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  36.46 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.58 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  34.78 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  33.91 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  30.28 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  37.62 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  38.1 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  39.42 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  37.25 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.29 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.64 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.7 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  30.83 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  32.38 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>