51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2015 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
170 aa  352  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  46.95 
 
 
166 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.82 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  42.77 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.83 
 
 
172 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  42.33 
 
 
162 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  39.76 
 
 
165 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  40 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.36 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  39.13 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  37.95 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.5 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  35.59 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  33.94 
 
 
169 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.76 
 
 
163 aa  104  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.55 
 
 
170 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  32.73 
 
 
185 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.9 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  28.66 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  31.29 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.94 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  34.97 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  32.12 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.55 
 
 
162 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  34.13 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  30.91 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  36.14 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  35.98 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.55 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.64 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  30.54 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.52 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  30.91 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  32.34 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  32.54 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.7 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  34.1 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  27.38 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  28.74 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  32.06 
 
 
127 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  28.4 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.26 
 
 
198 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  26.44 
 
 
201 aa  41.2  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2291  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.1 
 
 
598 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>