More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1794 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  48.45 
 
 		 936 aa  877    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 893 aa  651    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.39 
 
 		 891 aa  702    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 924 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  100 
 
 		 926 aa  1902    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 936 aa  662    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 928 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 906 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 946 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 918 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 936 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  48.68 
 
 		 939 aa  875    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 921 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 892 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 921 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 932 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 944 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 933 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 926 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 896 aa  664    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 896 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  46.09 
 
 		 939 aa  836    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 921 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41 
 
 		 929 aa  678    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 942 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 926 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 941 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 		 923 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 932 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.26 
 
 		 934 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 923 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 923 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.62 
 
 		 903 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 937 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.74 
 
 		 891 aa  750    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 917 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  42.69 
 
 		 945 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.66 
 
 		 938 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  42.17 
 
 		 924 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 934 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.06 
 
 		 892 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.71 
 
 		 939 aa  697    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 934 aa  656    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 932 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 945 aa  732    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 931 aa  677    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  47.6 
 
 		 963 aa  867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  42.37 
 
 		 928 aa  705    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.63 
 
 		 892 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  42.3 
 
 		 926 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 936 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 928 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 930 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 928 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 934 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 926 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 922 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  41.06 
 
 		 913 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 928 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 926 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 928 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 928 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 913 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 903 aa  691    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 893 aa  646    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  42.32 
 
 		 950 aa  678    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.67 
 
 		 943 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  41.98 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 892 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.36 
 
 		 928 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.72 
 
 		 915 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  47.68 
 
 		 946 aa  867    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 935 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 939 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 951 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 943 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 922 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 922 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 912 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 930 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 917 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  41.68 
 
 		 917 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 917 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.08 
 
 		 928 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 928 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 923 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  47.89 
 
 		 949 aa  895    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  42.72 
 
 		 926 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 892 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 902 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 911 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 922 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 888 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 893 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 946 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>