More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1775 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1775  grpE protein  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  49.38 
 
 		 204 aa  157  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  51.06 
 
 		 206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  42.94 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  41.71 
 
 		 179 aa  141  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  43.65 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  42.08 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  44.52 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.68 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  35.9 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  46.27 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  38.62 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.41 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  40.38 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  41.79 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  37.74 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.66 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.59 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.55 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  40 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  39.35 
 
 		 282 aa  97.1  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.04 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  40.46 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  38.62 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.01 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  36.09 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.22 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.14 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  37.5 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.04 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  37.04 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.86 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  33.17 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  33.17 
 
 		 250 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.48 
 
 		 286 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.32 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  35.14 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  33.86 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.87 
 
 		 246 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  34.59 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  35.62 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  34.67 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  35.14 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  33.13 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.26 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  35.82 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.27 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  28.86 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  33.33 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  33.94 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.73 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  33.95 
 
 		 245 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.7 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.82 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.32 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.85 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  32.14 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.93 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.93 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  32.78 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  32.58 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  32.02 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.33 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.57 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.97 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  33.1 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  30.73 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.37 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.21 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  28.03 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>