More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1735 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
173 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
182 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.89 
 
 
163 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 
187 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.58 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  31.76 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.21 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  28.81 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  30.41 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  33.09 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.03 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.03 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.03 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.03 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  32.98 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  30 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  28.82 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  34.21 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  30 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.21 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  27.59 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  26.44 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  25.7 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  27.2 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  33.65 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  25.7 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  31.67 
 
 
265 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
291 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  28.12 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  25.84 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.46 
 
 
338 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
280 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>