More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1732 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  50.67 
 
 		 316 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  50.5 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  51.37 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  51.36 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  48.3 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  47.42 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  47.6 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  46.23 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  45.64 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  41.52 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  43.69 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  42.51 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  41.5 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  42.61 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  40.83 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  42.51 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.75 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.87 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  39.79 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.41 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  39.67 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  39.24 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.87 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  40.71 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  38.54 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.33 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39.66 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.62 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  38.68 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  37.94 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  38.99 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  39.07 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  38.6 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  41.11 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.21 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  41.11 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  39.12 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  38.99 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  38.99 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.99 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  35.52 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  38.99 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  38.99 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  38.25 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  38.25 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  38.54 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  37.7 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  38.27 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.64 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  39.02 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  41.4 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>