More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1731 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.62 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 162 aa  146  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.18 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  46.62 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.51 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 177 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.56 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.52 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  43.33 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.83 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  43.7 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  44.78 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  45.03 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  43.36 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.48 
 
 		 150 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  43.36 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.68 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  51.16 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.53 
 
 		 160 aa  120  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  43.7 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>