191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1723 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 84 aa  165  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  59.52 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  50 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  55.42 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.11 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  37.21 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  38.64 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 88 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  34.94 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>