More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1701 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  100 
 
 		 602 aa  1241    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  37.84 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  40.63 
 
 		 338 aa  240  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  41.23 
 
 		 350 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  35.66 
 
 		 428 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  36.32 
 
 		 399 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  35.69 
 
 		 444 aa  208  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  39 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  33.25 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  33.99 
 
 		 438 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  34.64 
 
 		 429 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  31.82 
 
 		 419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.43 
 
 		 231 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  31.81 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  41.28 
 
 		 238 aa  181  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  40.25 
 
 		 238 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  31.47 
 
 		 420 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  33.65 
 
 		 312 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  30.29 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  28.5 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  30.13 
 
 		 405 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  42.49 
 
 		 240 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  41.88 
 
 		 233 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  32.28 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.76 
 
 		 394 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  40.87 
 
 		 230 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  39.24 
 
 		 238 aa  164  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  41.1 
 
 		 244 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.17 
 
 		 253 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  30.99 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.48 
 
 		 307 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  32.52 
 
 		 363 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  29.32 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  29.46 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  42.49 
 
 		 233 aa  161  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  32.19 
 
 		 412 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.87 
 
 		 333 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  28.32 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  28.72 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.58 
 
 		 313 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  39.22 
 
 		 237 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  38.77 
 
 		 241 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  40.27 
 
 		 250 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  28.68 
 
 		 447 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.56 
 
 		 311 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  26.82 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.51 
 
 		 255 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  40.47 
 
 		 248 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  39.73 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.23 
 
 		 328 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  30.07 
 
 		 381 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.14 
 
 		 433 aa  151  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.35 
 
 		 256 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  39.84 
 
 		 252 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  39.91 
 
 		 253 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  36.59 
 
 		 245 aa  150  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  28.33 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  31.64 
 
 		 390 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  27.48 
 
 		 450 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  35.91 
 
 		 241 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.17 
 
 		 412 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.11 
 
 		 320 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  36.62 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.08 
 
 		 251 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.45 
 
 		 245 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.25 
 
 		 315 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  40.74 
 
 		 298 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  45.54 
 
 		 238 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 		 227 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 355 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  37.39 
 
 		 238 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.71 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.8 
 
 		 320 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  31.48 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  31.73 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  38.79 
 
 		 250 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.32 
 
 		 279 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  26.34 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  31.37 
 
 		 323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 		 317 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 		 242 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  30.86 
 
 		 388 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 323 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  39.92 
 
 		 250 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.16 
 
 		 242 aa  137  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.95 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.86 
 
 		 237 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  31.48 
 
 		 323 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 		 456 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  29.17 
 
 		 323 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  38.1 
 
 		 247 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  36.13 
 
 		 239 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>