133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1588 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1588  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3664  protein of unknown function DUF147  38.43 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  39.2 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  36.19 
 
 
267 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424846  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  38.75 
 
 
259 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3222  hypothetical protein  37.85 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2673  protein of unknown function DUF147  37.98 
 
 
272 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0979308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  36.84 
 
 
293 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2660  hypothetical protein  40.69 
 
 
285 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2346  hypothetical protein  40.69 
 
 
285 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  32.93 
 
 
275 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0135  hypothetical protein  35.39 
 
 
278 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.575815  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  34.92 
 
 
285 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  35.92 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  34.54 
 
 
248 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0161  protein of unknown function DUF147  34.96 
 
 
239 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2672  protein of unknown function DUF147  35.34 
 
 
273 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1166  hypothetical protein  36.48 
 
 
292 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000552202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1201  protein of unknown function DUF147  32.38 
 
 
309 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  32.93 
 
 
261 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  32.65 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0255  protein of unknown function DUF147  35.86 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000845039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1764  hypothetical protein  32.93 
 
 
269 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  33.47 
 
 
275 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0152  protein of unknown function DUF147  35.1 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  34.32 
 
 
275 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000675285  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  32.81 
 
 
276 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  32.79 
 
 
273 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  34.55 
 
 
297 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  31.58 
 
 
273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  33.6 
 
 
272 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  31.85 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  32.79 
 
 
273 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  34.01 
 
 
277 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0885  hypothetical protein  32.79 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2195  hypothetical protein  32.53 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2233  hypothetical protein  32.53 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.785168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  31.45 
 
 
273 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  31.23 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  33.47 
 
 
266 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  31.12 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1909  hypothetical protein  30.83 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  32.24 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1785  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  30.95 
 
 
470 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0652  hypothetical protein  35.22 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  34.02 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0400  protein of unknown function DUF147  29.08 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  34.01 
 
 
266 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0292  hypothetical protein  33.6 
 
 
274 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3416  hypothetical protein  31.97 
 
 
267 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  33.07 
 
 
382 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1232  hypothetical protein  34.26 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0477  hypothetical protein  33.61 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0057  protein of unknown function DUF147  32.66 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  28.46 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1715  protein of unknown function DUF147  31.33 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2732  hypothetical protein  33.6 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2186  protein of unknown function DUF147  33.61 
 
 
260 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  33.06 
 
 
277 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  31.4 
 
 
273 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  29.03 
 
 
470 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0008  hypothetical protein  29.39 
 
 
256 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.487751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  29.1 
 
 
471 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2254  hypothetical protein  34.87 
 
 
261 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  33.47 
 
 
283 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2524  protein of unknown function DUF147  29.49 
 
 
248 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  30.4 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  30.8 
 
 
388 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  31.05 
 
 
282 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1807  hypothetical protein  30.8 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.895114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  29.6 
 
 
471 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  30.04 
 
 
480 aa  118  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1497  hypothetical protein  33.47 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  31.33 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1888  hypothetical protein  29.66 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000352181  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0832  protein of unknown function DUF147  30.12 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000526426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1597  protein of unknown function DUF147  30.29 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2637  protein of unknown function DUF147  30.99 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5065  hypothetical protein  42.02 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0182  hypothetical protein  43.1 
 
 
201 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  30.12 
 
 
288 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3531  hypothetical protein  42.74 
 
 
201 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4742  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4652  hypothetical protein  40.16 
 
 
201 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  29.49 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2370  protein of unknown function DUF147  33.06 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2458  protein of unknown function DUF147  33.06 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5059  hypothetical protein  41.18 
 
 
201 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0124  protein of unknown function DUF147  31.75 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0678781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0127  protein of unknown function DUF147  31.75 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1392  hypothetical protein  29.84 
 
 
276 aa  111  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4632  hypothetical protein  41.18 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  28.63 
 
 
279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>