More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1513 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 438 aa  907    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 235 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.22 
 
 		 222 aa  99.8  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 222 aa  99.8  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.76 
 
 		 196 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 208 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 447 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 212 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 201 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 201 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 211 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 209 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 214 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.61 
 
 		 205 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.38 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.3 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 200 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 201 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 210 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.16 
 
 		 200 aa  86.3  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 219 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 200 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 200 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.54 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.57 
 
 		 200 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.57 
 
 		 200 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.67 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.38 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 200 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 214 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  34.44 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  26.84 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.98 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.98 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.98 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.69 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  29.44 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 201 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.9 
 
 		 203 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 233 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.87 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.14 
 
 		 203 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.23 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.12 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.22 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.9 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.66 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.27 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.06 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.72 
 
 		 203 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 197 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 		 189 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.63 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.36 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>