64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1500 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1578    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  64.19 
 
 		 761 aa  942    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  68.51 
 
 		 526 aa  633  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  30.82 
 
 		 1669 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 1642 aa  293  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.56 
 
 		 1706 aa  291  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.11 
 
 		 1669 aa  289  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34.25 
 
 		 1649 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  35.28 
 
 		 1722 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  36.9 
 
 		 2098 aa  268  4e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  32.82 
 
 		 2274 aa  267  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.14 
 
 		 1726 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  29.97 
 
 		 2077 aa  260  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  33.21 
 
 		 1932 aa  260  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.17 
 
 		 1934 aa  259  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.58 
 
 		 1925 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  33.66 
 
 		 1575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 1516 aa  240  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  31.78 
 
 		 1697 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 1697 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  33.66 
 
 		 1606 aa  237  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  27.77 
 
 		 1702 aa  235  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  31.64 
 
 		 2117 aa  234  6e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1748 aa  234  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  31.05 
 
 		 1700 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 2570 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  27.42 
 
 		 1703 aa  225  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 		 1674 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  30.41 
 
 		 1701 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 1693 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 1594 aa  207  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  28.27 
 
 		 766 aa  203  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  30.6 
 
 		 976 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  29.96 
 
 		 2005 aa  190  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.04 
 
 		 1956 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  31.99 
 
 		 1417 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  26.27 
 
 		 1211 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  25.43 
 
 		 678 aa  98.2  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  19.3 
 
 		 1379 aa  87.4  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  25.58 
 
 		 953 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 986 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.31 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 969 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  30.28 
 
 		 958 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 958 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  24.51 
 
 		 1031 aa  52.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  40.74 
 
 		 1328 aa  52  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  24.02 
 
 		 541 aa  52  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  33.33 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  42.19 
 
 		 968 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  20.05 
 
 		 1069 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  36.36 
 
 		 950 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  24.6 
 
 		 872 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  21.2 
 
 		 1284 aa  48.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  28.32 
 
 		 946 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1046 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  33 
 
 		 900 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  20.58 
 
 		 1069 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  40.28 
 
 		 940 aa  46.2  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  40.3 
 
 		 1082 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  36.05 
 
 		 894 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 945 aa  45.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  28.32 
 
 		 941 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  37.31 
 
 		 840 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>