More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1495 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 697 aa  1434    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  45.04 
 
 		 689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  46.57 
 
 		 608 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  36.71 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  35.65 
 
 		 746 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  38.73 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  39.75 
 
 		 721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  37.73 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  38.13 
 
 		 722 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  35.13 
 
 		 695 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  38.19 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  35.86 
 
 		 754 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  36.01 
 
 		 867 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  34.41 
 
 		 719 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  37 
 
 		 729 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  33.93 
 
 		 712 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  35.18 
 
 		 675 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  37.06 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  35.93 
 
 		 846 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  36.83 
 
 		 729 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  35.52 
 
 		 839 aa  357  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  35.48 
 
 		 876 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  35.14 
 
 		 768 aa  356  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  35.48 
 
 		 876 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  34.11 
 
 		 707 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  37 
 
 		 729 aa  354  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 865 aa  354  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 865 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 729 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 729 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 729 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 729 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 729 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  36.11 
 
 		 908 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  36.95 
 
 		 729 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  35.24 
 
 		 865 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  34.16 
 
 		 854 aa  350  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 906 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  35 
 
 		 865 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 869 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  35.54 
 
 		 873 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  36.06 
 
 		 729 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  36.07 
 
 		 730 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  34.82 
 
 		 865 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  35.08 
 
 		 891 aa  347  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  34.82 
 
 		 865 aa  347  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  37.94 
 
 		 697 aa  347  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  35.62 
 
 		 573 aa  347  6e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  34.82 
 
 		 865 aa  347  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  35.74 
 
 		 877 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  35.64 
 
 		 896 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  34.7 
 
 		 851 aa  346  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  34.01 
 
 		 920 aa  345  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  35.01 
 
 		 888 aa  343  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  34.96 
 
 		 891 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  34.15 
 
 		 876 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  34.45 
 
 		 889 aa  342  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  35.76 
 
 		 879 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  35.16 
 
 		 731 aa  340  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  33.79 
 
 		 980 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  34.4 
 
 		 992 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  34.91 
 
 		 990 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  35.2 
 
 		 731 aa  336  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  34.24 
 
 		 975 aa  336  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  34.55 
 
 		 982 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  34.37 
 
 		 620 aa  331  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  33.51 
 
 		 981 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  34.14 
 
 		 1002 aa  330  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  33.95 
 
 		 711 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.52 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  33.64 
 
 		 981 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  33.95 
 
 		 711 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  34.42 
 
 		 920 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  34.47 
 
 		 939 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  33.42 
 
 		 869 aa  327  6e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  31.06 
 
 		 815 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  32.88 
 
 		 718 aa  323  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 		 670 aa  320  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  31.35 
 
 		 714 aa  318  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  34.88 
 
 		 670 aa  318  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 666 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  34.26 
 
 		 670 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 711 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  33.82 
 
 		 670 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  32.79 
 
 		 741 aa  310  8e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  33.47 
 
 		 876 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  33.28 
 
 		 680 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0351  topoisomerase III  33.24 
 
 		 719 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  30.8 
 
 		 777 aa  306  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  34 
 
 		 676 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  34 
 
 		 676 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  31.39 
 
 		 714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  33.75 
 
 		 670 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  31.39 
 
 		 714 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  31.39 
 
 		 714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>