More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1378 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 407 aa  844    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  43.77 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  44.74 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  40.69 
 
 		 344 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  44.25 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.66 
 
 		 351 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  43.49 
 
 		 349 aa  258  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  43.08 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.05 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  42.62 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.12 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  41.23 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  40.53 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  38.79 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.68 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  43.89 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.48 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  43.89 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  43.89 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.95 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  43.89 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.48 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.85 
 
 		 364 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  38.48 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.18 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.19 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.02 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.19 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.06 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  33.6 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.11 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  34.96 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  39.7 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  34.2 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  34.76 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  37.46 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.66 
 
 		 357 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.93 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  47.53 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.79 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  35.37 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  35.11 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  35.11 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  36.87 
 
 		 352 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.06 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.58 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.09 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  37.36 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.47 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  37.42 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  35.56 
 
 		 434 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  33.96 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  34.77 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  42.59 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  40.15 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  34.46 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  34.2 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  37.05 
 
 		 464 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.93 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 		 358 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.42 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  47.25 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  35.58 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  35.31 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 615 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  37.34 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.94 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.08 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.94 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  36.09 
 
 		 354 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  33.62 
 
 		 362 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  34.94 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  35.05 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  33.61 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>