115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1335 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  45.04 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.6 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  34.31 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  36.89 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  39.23 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  37.88 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.11 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  33.59 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  34.85 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  35.04 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  35.42 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  43.96 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  33.61 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  34.51 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  37.23 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  41.09 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  40.23 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  37.98 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  33.12 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  31.75 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  33.83 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.08 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  27.78 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  27.41 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  32.58 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  28.3 
 
 
430 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  31.96 
 
 
143 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  35.77 
 
 
140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  35.77 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  32.33 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  29.25 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  33.7 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  33.82 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  36.9 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.33 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  38.28 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  31.54 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  31.16 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2223  hypothetical protein  36.49 
 
 
214 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  30.87 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  34.21 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  29.71 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  40.31 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  29.8 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  32.06 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  31.08 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  28.08 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  31.03 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 
453 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  31.3 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  38.24 
 
 
152 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  28.08 
 
 
158 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  31.17 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  27.46 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  27.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  27.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.89 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  26.32 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  31.43 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  32.33 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  27.03 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  32.87 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.75 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  26.76 
 
 
446 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  26.06 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  28.17 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  25.78 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  28 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  28.93 
 
 
143 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  30.53 
 
 
144 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  26.17 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  28.24 
 
 
147 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  28.78 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  28.78 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  28.78 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>