More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1324 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  56.54 
 
 
200 aa  220  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  57.22 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  57.3 
 
 
181 aa  217  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.68 
 
 
187 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  56.45 
 
 
184 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  54.89 
 
 
182 aa  206  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.32 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.72 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.84 
 
 
174 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.51 
 
 
191 aa  167  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  40.8 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.57 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  39.55 
 
 
176 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.97 
 
 
191 aa  131  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 
164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  41.45 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  36.78 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  39.66 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.95 
 
 
187 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
171 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  39.66 
 
 
173 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  39.66 
 
 
173 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.83 
 
 
187 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  39.2 
 
 
173 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.85 
 
 
173 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 
173 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.11 
 
 
173 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.91 
 
 
163 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 
173 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  39.08 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.68 
 
 
165 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.13 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  40.72 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.9 
 
 
186 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  44.78 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
164 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.55 
 
 
185 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  38.31 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 
173 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.82 
 
 
164 aa  115  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 
194 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  36.78 
 
 
173 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.06 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38.22 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.05 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  42.42 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 
161 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  41.82 
 
 
173 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.88 
 
 
183 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  41.82 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  40.24 
 
 
173 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.8 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.82 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  37.71 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  38.55 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
284 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 
181 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
275 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
164 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  34.44 
 
 
182 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  43.85 
 
 
167 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.19 
 
 
186 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.82 
 
 
166 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  37.82 
 
 
183 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  36.78 
 
 
173 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
180 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>