62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1283 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  100 
 
 
720 aa  1495    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  39.97 
 
 
704 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  40.99 
 
 
714 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  39.39 
 
 
718 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  38.79 
 
 
712 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  36.43 
 
 
722 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  36.33 
 
 
714 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  35.42 
 
 
721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  32.5 
 
 
725 aa  346  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  32.34 
 
 
720 aa  333  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  32.52 
 
 
716 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  31.82 
 
 
718 aa  327  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  32.22 
 
 
731 aa  327  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  31.56 
 
 
718 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  31.56 
 
 
718 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  31.1 
 
 
715 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  32.41 
 
 
718 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  31.49 
 
 
718 aa  321  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  32.83 
 
 
707 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  32.69 
 
 
718 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  32.44 
 
 
718 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  31.11 
 
 
716 aa  319  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  31.42 
 
 
718 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  32.51 
 
 
718 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  31.12 
 
 
721 aa  317  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  32.42 
 
 
718 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  31.2 
 
 
718 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  31.58 
 
 
718 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  31.1 
 
 
718 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  31.81 
 
 
718 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  29.88 
 
 
786 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  30.17 
 
 
738 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  29.62 
 
 
732 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  30.61 
 
 
718 aa  294  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  29.75 
 
 
732 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  29.39 
 
 
732 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  29.09 
 
 
732 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  29.21 
 
 
732 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  29.05 
 
 
732 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  29.29 
 
 
732 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  29.26 
 
 
732 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  28.34 
 
 
743 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  28.86 
 
 
732 aa  276  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  28.89 
 
 
732 aa  276  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  29.37 
 
 
731 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  28.76 
 
 
729 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  28.63 
 
 
734 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  27.76 
 
 
739 aa  264  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  27.43 
 
 
941 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  30.5 
 
 
767 aa  259  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  28.16 
 
 
740 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  27.41 
 
 
710 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  26.37 
 
 
701 aa  170  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  24.19 
 
 
688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  31.62 
 
 
751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  27.15 
 
 
713 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.07 
 
 
706 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.07 
 
 
706 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  26.42 
 
 
706 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.36 
 
 
714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  28.4 
 
 
711 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  29.39 
 
 
759 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>