More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1256 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1256  ribonuclease  100 
 
 		 504 aa  1035    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  50.3 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  50.7 
 
 		 543 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  49.6 
 
 		 516 aa  501  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  50.3 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  48.71 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  50.2 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  48.8 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  47.41 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  48.81 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  39.11 
 
 		 562 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  39.03 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  38.22 
 
 		 565 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  38.56 
 
 		 568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  39.69 
 
 		 551 aa  350  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  38.4 
 
 		 570 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  38.28 
 
 		 566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  36.27 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.18 
 
 		 503 aa  290  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  32.53 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  33.4 
 
 		 543 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.06 
 
 		 503 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.62 
 
 		 496 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.62 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  34.39 
 
 		 537 aa  279  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.87 
 
 		 559 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  35.37 
 
 		 497 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  34.14 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  35.96 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  35.15 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.43 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  33.4 
 
 		 636 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  32.97 
 
 		 496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  32.97 
 
 		 496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  32.67 
 
 		 515 aa  273  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.57 
 
 		 562 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.84 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.75 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  36.19 
 
 		 908 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  34.5 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  35.51 
 
 		 702 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  39.01 
 
 		 604 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  34.51 
 
 		 492 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  35.38 
 
 		 1007 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  36.6 
 
 		 1427 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35.65 
 
 		 1194 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.08 
 
 		 499 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  30.49 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  36.17 
 
 		 990 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  32.5 
 
 		 487 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  32.17 
 
 		 496 aa  256  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.74 
 
 		 808 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  34.67 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.43 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  35.82 
 
 		 1041 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  33.41 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  34.04 
 
 		 483 aa  253  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  35.93 
 
 		 653 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  35.93 
 
 		 653 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  35.87 
 
 		 903 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  35.51 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  35.76 
 
 		 1070 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  34.14 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  34.52 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  32.84 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.85 
 
 		 741 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  35.45 
 
 		 944 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  33.94 
 
 		 1024 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  31.66 
 
 		 485 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  36.06 
 
 		 1265 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  35.7 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1269  ribonuclease  31.06 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  34.68 
 
 		 922 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  35.63 
 
 		 919 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  33.48 
 
 		 1058 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  32.16 
 
 		 1025 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  33.47 
 
 		 490 aa  249  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  33.18 
 
 		 1093 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  32.16 
 
 		 1029 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  34.06 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  35.48 
 
 		 959 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  35.38 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  35.22 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  34.72 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  35.68 
 
 		 713 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  36.12 
 
 		 1043 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  32.71 
 
 		 488 aa  247  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  31.54 
 
 		 1056 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  33.97 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  31.54 
 
 		 1059 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  34.2 
 
 		 792 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  31.54 
 
 		 1068 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  31.54 
 
 		 1059 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  31.64 
 
 		 1053 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  33.41 
 
 		 517 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  33.27 
 
 		 489 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  34.61 
 
 		 489 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  34.35 
 
 		 866 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  35.58 
 
 		 1117 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>