More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1115 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  100 
 
 		 445 aa  903    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  70.5 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  68.52 
 
 		 441 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  67.34 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.49 
 
 		 443 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  69.78 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  66.82 
 
 		 439 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  70.91 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  64.09 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  61.24 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  58.82 
 
 		 442 aa  522  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  55.16 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  56.94 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.83 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.24 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  56.74 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  56.31 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  56.78 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.87 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.16 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  54.02 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  55.81 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  55.14 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  54.88 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  55.61 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  53.24 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.71 
 
 		 448 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  54.55 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  52.55 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  52.55 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.73 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  53.19 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.7 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.73 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.56 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  54.1 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  53.61 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  54.15 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  53.1 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.24 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  54.27 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  51.13 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.63 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  52.16 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.2 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.21 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  53.46 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.66 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.81 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.83 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  48.77 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  53 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  53.23 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  51.8 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.34 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  49.02 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.92 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.26 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.48 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  51.02 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  51.56 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.87 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  53.12 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.92 
 
 		 528 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  52.22 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.48 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  49.21 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  52.13 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.45 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  51.44 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>