More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1079 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  59.92 
 
 
260 aa  304  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  58.91 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  59.14 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.53 
 
 
260 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.59 
 
 
260 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.81 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  56.03 
 
 
260 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  55.64 
 
 
260 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 
259 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  54.51 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  53.31 
 
 
260 aa  264  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.94 
 
 
258 aa  261  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
260 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  52.85 
 
 
262 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
260 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.97 
 
 
260 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  51.36 
 
 
257 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
259 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
260 aa  235  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.17 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 
260 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 
258 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
260 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
257 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 
257 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
259 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
260 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  47.88 
 
 
259 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
257 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
260 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  48.79 
 
 
258 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
260 aa  228  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
265 aa  228  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.83 
 
 
258 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 
260 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
257 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
259 aa  224  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 
260 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 
260 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
258 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
257 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
258 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 
260 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
258 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  49.41 
 
 
258 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  49.02 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
258 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.47 
 
 
259 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
265 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.64 
 
 
260 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
258 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
258 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 
260 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
258 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
259 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
261 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 
259 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
259 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.27 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  48.16 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.31 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.98 
 
 
258 aa  215  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
259 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  47.67 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
259 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  47.31 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.7 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.84 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
264 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>