More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1060 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 569 aa  1161    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  42.07 
 
 		 550 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  42.44 
 
 		 557 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 550 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  41.52 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 566 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 545 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  36.15 
 
 		 540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  37.73 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 553 aa  320  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  35.69 
 
 		 582 aa  293  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 563 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  33.86 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  35.02 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.58 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 585 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 		 444 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.99 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.66 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.69 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  32.81 
 
 		 842 aa  217  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.73 
 
 		 440 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.38 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  34 
 
 		 552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.5 
 
 		 439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  35.85 
 
 		 441 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.08 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 418 aa  212  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.98 
 
 		 458 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  32.53 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.73 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.84 
 
 		 448 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.81 
 
 		 457 aa  210  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.65 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  38.98 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.43 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.12 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.41 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 515 aa  207  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 445 aa  207  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  36.04 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.17 
 
 		 434 aa  206  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 437 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  33.41 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  33.86 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.52 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.75 
 
 		 439 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  35.12 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 560 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 472 aa  203  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 513 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  33.86 
 
 		 511 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.27 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  35.76 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  35.76 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  35.76 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  35.76 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  35.76 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  33.98 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.06 
 
 		 445 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.06 
 
 		 445 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  36.06 
 
 		 521 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  35.87 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  33.62 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>