More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0990 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  130  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  72.58 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 
65 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  64.06 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  66.13 
 
 
64 aa  81.6  3e-15  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  67.19 
 
 
64 aa  81.6  4e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
64 aa  77  8e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  75.1  3e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  73.2  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.88111e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.38 
 
 
68 aa  72.8  2e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  72  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  70.9  6e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  9.05032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  70.9  6e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  3.7882e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  70.5  7e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.18579e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 
65 aa  70.1  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.87397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  68.9  2e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 
65 aa  68.9  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.90331e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  68.9  2e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  68.9  2e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  68.6  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.59393e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  60.32 
 
 
64 aa  68.6  3e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  68.2  4e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.96271e-12  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  67.8  5e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67.4  7e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  67  9e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  67  9e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.64492e-06  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  66.6  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.90106e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  65.5  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  65.5  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  64.7  4e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.48702e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  64.7  5e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  64.3  6e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.5  8e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  63.5  9e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  1.82997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  47.69 
 
 
65 aa  63.5  9e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  5.71086e-06  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  7.71602e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  1.05441e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
67 aa  63.2  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
73 aa  63.5  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  62.4  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62  2e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  62.4  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
66 aa  62.4  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.9252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  4.16006e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 
79 aa  62.4  2e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
67 aa  62  3e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
66 aa  61.2  4e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.56581e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
65 aa  61.2  4e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
65 aa  61.6  4e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  61.2  5e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  61.2  5e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.39111e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.8  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  60.8  5e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.8  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
67 aa  60.8  6e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
81 aa  60.8  6e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
67 aa  60.8  6e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  7e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.1  9e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7021e-09 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
94 aa  59.7  1e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  59.7  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  50.77 
 
 
65 aa  58.9  2e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  57.63 
 
 
65 aa  58.9  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  59.3  2e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  59.3  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.9  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
64 aa  59.3  2e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.92427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  59.3  2e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.60763e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  59.3  2e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
67 aa  58.2  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
63 aa  58.5  3e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  58.2  3e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.5  3e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  2.76792e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.5  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  58.2  4e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  58.2  4e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  58.2  4e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.43813e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>