More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0956 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  100 
 
 		 431 aa  879    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  31.57 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  29.85 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  28.99 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  29.95 
 
 		 412 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  29.13 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  27.53 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  26.7 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  29.98 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  27.47 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  31.36 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  28.51 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  39.51 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  27.34 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  26.85 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  26.73 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  27.53 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  28.85 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  26.15 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.13 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  26.38 
 
 		 456 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  22.85 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  26.38 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.38 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.83 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  22.62 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.88 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.5 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25.25 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.56 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.66 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  29.38 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.33 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.44 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.71 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.37 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.44 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  23.61 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  28.03 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  32.12 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  25.53 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  29.47 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.25 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  26.01 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  24.75 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  22.3 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.41 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.33 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  25.63 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  36.29 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  36.15 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  36.51 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  22.67 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  23.06 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  26.2 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  31.08 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  23.58 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  32.31 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  28.15 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.62 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.11 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  26.48 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  33.56 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.11 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  33.06 
 
 		 318 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.89 
 
 		 379 aa  67  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  31.52 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  30.77 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  31.52 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  32.06 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.53 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.52 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  36.84 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  20.61 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  31.34 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  29.63 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  31.3 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.58 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  30.13 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  24.06 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  24.87 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  33.07 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  32.39 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  33.87 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  23.62 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  23.62 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  23.62 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  23.62 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  28.39 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  23.62 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  32.85 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  30.77 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  23.62 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  23.62 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  33.83 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.71 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>