149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0934 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  60.06 
 
 
687 aa  778  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  61.65 
 
 
630 aa  812  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1321  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  46.4 
 
 
648 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  46.23 
 
 
648 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  46.26 
 
 
605 aa  541  1e-152  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  45.77 
 
 
603 aa  539  1e-152  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  46.66 
 
 
598 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  46.66 
 
 
599 aa  535  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 
658 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 
648 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 
673 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  44.1 
 
 
607 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 
688 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  43.3 
 
 
671 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  42.95 
 
 
677 aa  516  1e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  43.98 
 
 
679 aa  516  1e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 
679 aa  516  1e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  42.37 
 
 
707 aa  518  1e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  40.38 
 
 
763 aa  516  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  2.31874e-06 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.19 
 
 
688 aa  517  1e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  44.1 
 
 
678 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  41.35 
 
 
766 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 
755 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  41.92 
 
 
674 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  41.19 
 
 
710 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 
605 aa  508  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  41.86 
 
 
819 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  40.09 
 
 
747 aa  506  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  41.86 
 
 
807 aa  505  1e-142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  41.86 
 
 
812 aa  505  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  42.72 
 
 
623 aa  508  1e-142  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  41.73 
 
 
625 aa  505  1e-142  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  41.86 
 
 
816 aa  505  1e-142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  38.81 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  41.55 
 
 
786 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  39.8 
 
 
747 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  41.07 
 
 
790 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  38.81 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 
739 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  40.39 
 
 
758 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  41.55 
 
 
781 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  42.04 
 
 
787 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  38.81 
 
 
739 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  42.04 
 
 
775 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  41.55 
 
 
781 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  41.73 
 
 
785 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  41.55 
 
 
781 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  42.17 
 
 
721 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  44.32 
 
 
683 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  40.18 
 
 
723 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  40.18 
 
 
723 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  40.18 
 
 
723 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  40.18 
 
 
723 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  40.18 
 
 
723 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  43.99 
 
 
639 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  39.79 
 
 
787 aa  493  1e-138  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  42.27 
 
 
806 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  42.43 
 
 
777 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  39.74 
 
 
773 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  39.12 
 
 
724 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  40.27 
 
 
763 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  41.93 
 
 
774 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 
745 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  39.57 
 
 
790 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  41.39 
 
 
622 aa  488  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  41.07 
 
 
662 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  39.67 
 
 
784 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  41.31 
 
 
770 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  40 
 
 
781 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  41.6 
 
 
780 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  40.94 
 
 
789 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  41.53 
 
 
620 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  40.19 
 
 
642 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  40.6 
 
 
662 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  42.83 
 
 
740 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  42.45 
 
 
612 aa  469  1e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
640 aa  470  1e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 
621 aa  467  1e-130  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 
607 aa  467  1e-130  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.09081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 
598 aa  467  1e-130  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  42.08 
 
 
589 aa  460  1e-128  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 
600 aa  461  1e-128  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  40.03 
 
 
685 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  41.77 
 
 
614 aa  453  1e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 
666 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 
567 aa  446  1e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 
567 aa  446  1e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  38.73 
 
 
718 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.44 
 
 
646 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 
571 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 
568 aa  425  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 
554 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  37.68 
 
 
583 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 
680 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>