More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0898 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  540  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  40.65 
 
 		 250 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  36.51 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  41.88 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  42.86 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  42.39 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  42.39 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  42.39 
 
 		 306 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  41.67 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  34.11 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  42.33 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.73 
 
 		 315 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  44.44 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  37.73 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  41.99 
 
 		 358 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.94 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  41.58 
 
 		 316 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  41.99 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  41.99 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  41.99 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  31.17 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  32.79 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.03 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  41.99 
 
 		 347 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  41.99 
 
 		 474 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  39.38 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  41.99 
 
 		 347 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  37.56 
 
 		 358 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  32.64 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  39.27 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  41.32 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.22 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  41.4 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  40.53 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  34.1 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  42.16 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.09 
 
 		 320 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  40.91 
 
 		 751 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  40.91 
 
 		 728 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  40.91 
 
 		 728 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  37.89 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  37.89 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  37.04 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  37.04 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.41 
 
 		 727 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  41.3 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.99 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  36.51 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  36.51 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  36.51 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  36.51 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  35.98 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.9 
 
 		 728 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.25 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.68 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  39.44 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.67 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.35 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.4 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.88 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  47.06 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  40.32 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  39.9 
 
 		 728 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  37.5 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.5 
 
 		 760 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  39.9 
 
 		 728 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  40.1 
 
 		 733 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  38.38 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.93 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  35.9 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.11 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  40.22 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  32.36 
 
 		 733 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  33.49 
 
 		 345 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.47 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  41.08 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  28.44 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  43.5 
 
 		 335 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  35.66 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  38.96 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  32.67 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.58 
 
 		 748 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.61 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  30.31 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.5 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  33.61 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.61 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.61 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  33.2 
 
 		 798 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  33.61 
 
 		 804 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  41.11 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  33.2 
 
 		 796 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  36.78 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  39.49 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  33.02 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  36.36 
 
 		 335 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  38.68 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  39.33 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>