48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0868 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0868  mobilization protein  100 
 
 		 307 aa  638    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  41.39 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  36.22 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.71 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.88 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.74 
 
 		 392 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.74 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.78 
 
 		 807 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.85 
 
 		 804 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.09 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.42 
 
 		 431 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.51 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.05 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.54 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.15 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  25.84 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.37 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.28 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  30.66 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.02 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.95 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.61 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.1 
 
 		 421 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  30 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  37.04 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  27.89 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.23 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4380  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.11 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.97 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  25.19 
 
 		 713 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  24.55 
 
 		 830 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3761  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.37 
 
 		 421 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  21.88 
 
 		 873 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.24 
 
 		 557 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  21.76 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  32.32 
 
 		 899 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.37 
 
 		 635 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.89 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  24.72 
 
 		 746 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  24.72 
 
 		 746 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  30.3 
 
 		 899 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3656  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.4 
 
 		 777 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0486452  decreased coverage  0.000000302342 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3989  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.4 
 
 		 777 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.23 
 
 		 805 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  23.44 
 
 		 752 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.58 
 
 		 519 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3793  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  31.4 
 
 		 736 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00267002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>