More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0864 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  100 
 
 
206 aa  418  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  67.16 
 
 
202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  56.12 
 
 
206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  51.79 
 
 
211 aa  192  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  46.7 
 
 
217 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  40.21 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  39.59 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  32.83 
 
 
223 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  35.68 
 
 
204 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  32.14 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  33.59 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.29 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.16 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.7 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.41 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  31.16 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  31.85 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.61 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  31.11 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.34 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.26 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  30.5 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  32 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  32.45 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  28.92 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.97 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.97 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  30 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  30 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.53 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  29.17 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.26 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.26 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  29.87 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  29.67 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  32.32 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  28.29 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  29.29 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  30.87 
 
 
293 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.67 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  29.8 
 
 
309 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  30.87 
 
 
293 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  28.43 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.77 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.62 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  29.53 
 
 
294 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  30.32 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  30.72 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  27.78 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  30.05 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  32.5 
 
 
498 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  28.86 
 
 
294 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.87 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1181  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0644392 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  30.69 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  29.3 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  42.17 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  28.12 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2331  resolvase-like protein  32.97 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.385659  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 
305 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  27.81 
 
 
313 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 
252 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  28.14 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>