More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0790 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  100 
 
 
394 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.55 
 
 
334 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  64.13 
 
 
337 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.28 
 
 
359 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  64.56 
 
 
337 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  64.46 
 
 
333 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  61.89 
 
 
332 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  60.42 
 
 
333 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  63.08 
 
 
335 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  57.7 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.97 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  55.79 
 
 
337 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  55.69 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.29 
 
 
326 aa  319  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  52.74 
 
 
343 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  54.43 
 
 
338 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.08 
 
 
327 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.82 
 
 
338 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.31 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.7 
 
 
338 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  52.62 
 
 
338 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.34 
 
 
338 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.05 
 
 
338 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.47 
 
 
338 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.96 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.04 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.31 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.48 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.79 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.08 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48 
 
 
329 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48 
 
 
329 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.56 
 
 
426 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.78 
 
 
458 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.18 
 
 
333 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  44.93 
 
 
427 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.3 
 
 
351 aa  279  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  47.4 
 
 
343 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.48 
 
 
348 aa  278  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  45.53 
 
 
406 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  49.38 
 
 
346 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  43.38 
 
 
439 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  47.93 
 
 
354 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  47.93 
 
 
354 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  47.34 
 
 
406 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  46.99 
 
 
408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  47.93 
 
 
354 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.92 
 
 
350 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.99 
 
 
408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  52.61 
 
 
349 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  46.99 
 
 
408 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  46.75 
 
 
406 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.88 
 
 
408 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  52.04 
 
 
428 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  47.55 
 
 
343 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.95 
 
 
352 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.17 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.86 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.23 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  45.91 
 
 
342 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.62 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  51.41 
 
 
432 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.11 
 
 
344 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 
417 aa  272  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.47 
 
 
415 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.52 
 
 
434 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  47.01 
 
 
395 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  49.06 
 
 
354 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.39 
 
 
434 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.2 
 
 
435 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.81 
 
 
344 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  48.11 
 
 
345 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.81 
 
 
344 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  45.37 
 
 
335 aa  271  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  46.06 
 
 
348 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  46.65 
 
 
347 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.73 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  48.47 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  45.19 
 
 
382 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.95 
 
 
342 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  47.48 
 
 
391 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  47.55 
 
 
439 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  48.48 
 
 
341 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  49.37 
 
 
341 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  49.07 
 
 
371 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  47.95 
 
 
339 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.29 
 
 
358 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  44.57 
 
 
397 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  48.47 
 
 
345 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.2 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  48.18 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.25 
 
 
356 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  46.86 
 
 
350 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  45.75 
 
 
349 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.62 
 
 
365 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  47.35 
 
 
428 aa  265  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  47.23 
 
 
344 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  48.22 
 
 
359 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.61 
 
 
429 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  46.45 
 
 
422 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>