43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0789 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  33.48 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  30.46 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  30.84 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  29.07 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  32.29 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  30.1 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  37.39 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  30.15 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  32.24 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  28 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  27.4 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  31.93 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  29.82 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  29 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  34.75 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  30.57 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  27.14 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  25.22 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  26.79 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  30.43 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  31.58 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  28.26 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  27.86 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  31.52 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  29.44 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  27.56 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.86 
 
 		 806 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  38.24 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  25.94 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  28.41 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0797  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.13 
 
 		 804 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 801 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  25.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.47 
 
 		 808 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  25 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.15 
 
 		 808 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.41 
 
 		 792 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>