129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0742 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  100 
 
 
445 aa  921  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.75 
 
 
408 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.94 
 
 
440 aa  133  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.56 
 
 
421 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  25.44 
 
 
430 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  26.22 
 
 
422 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  28 
 
 
439 aa  117  4e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.41 
 
 
452 aa  115  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.06 
 
 
437 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.15 
 
 
427 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.17 
 
 
455 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.97 
 
 
482 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  26.67 
 
 
454 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.78 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  29.34 
 
 
449 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  26.04 
 
 
478 aa  96.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  24.95 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  25.66 
 
 
403 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  27.12 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  45.16 
 
 
442 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  86.3  1e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  24.35 
 
 
420 aa  79  2e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  25.24 
 
 
410 aa  76.3  1e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  30.68 
 
 
418 aa  73.2  8e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  45.45 
 
 
464 aa  70.1  8e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  38.18 
 
 
415 aa  69.3  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  27.73 
 
 
445 aa  67.4  6e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  27.98 
 
 
414 aa  66.6  8e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  25.38 
 
 
577 aa  65.9  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  38.27 
 
 
709 aa  65.1  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.7 
 
 
736 aa  64.7  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  62.79 
 
 
453 aa  64.3  4e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  37.04 
 
 
769 aa  63.2  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  37 
 
 
360 aa  62.8  1e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.53 
 
 
429 aa  59.3  1e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  32 
 
 
464 aa  58.9  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.25 
 
 
399 aa  57.4  5e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  56.1 
 
 
610 aa  55.8  1e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  24.72 
 
 
352 aa  55.1  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  23.34 
 
 
411 aa  53.9  5e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  27.85 
 
 
460 aa  53.9  5e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  32.61 
 
 
369 aa  53.5  7e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  45.61 
 
 
608 aa  52  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  27.56 
 
 
453 aa  52.4  2e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
360 aa  51.6  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
360 aa  51.6  3e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
360 aa  51.6  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  29.17 
 
 
452 aa  51.6  3e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
360 aa  51.6  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  1.17147e-09 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
361 aa  50.1  7e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
361 aa  50.1  8e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  50.1  9e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.48335e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
361 aa  49.7  9e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
361 aa  49.7  9e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  50.1  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  50.1  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  54.35 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  1.80359e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  46.15 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  5.23089e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  52.17 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.27918e-06  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  52.17 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  2.74736e-09 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  46.81 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  54.35 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  50 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.37842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  52.17 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  34.07 
 
 
564 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  42.86 
 
 
365 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  30.12 
 
 
672 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  35.79 
 
 
353 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  50 
 
 
358 aa  47  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  52.17 
 
 
359 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  40.43 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  46.81 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  50 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  50 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  52.17 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  24 
 
 
532 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  50 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  54.35 
 
 
360 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  47.83 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  42.86 
 
 
607 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  42.86 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  37.29 
 
 
176 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  45 
 
 
371 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  41.51 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  42.55 
 
 
531 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>