More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0734 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  45.61 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  40 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  40 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  36.46 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  36.78 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  41.34 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  38.33 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  36.31 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  36.63 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  37.08 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.72 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.33 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.72 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  35.2 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.31 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  34.48 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.75 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.08 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  34.64 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.79 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  35.2 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.08 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  34.55 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  34.24 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.82 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.14 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.07 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  32.96 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.83 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  33.71 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  38.46 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.02 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  35.23 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.32 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.7 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.65 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  29.89 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.85 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.52 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  30.39 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.02 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  29.73 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.77 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.22 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.65 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  31.67 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  32.18 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.51 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  35.76 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  32.96 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.99 
 
 		 279 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.73 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  35.9 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  30.05 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.96 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.76 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  28.27 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.92 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  29.57 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.52 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.53 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.61 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.52 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.75 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  29.35 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.58 
 
 		 814 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.95 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.21 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  30.85 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  30.85 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  29.41 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  29.41 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  30.85 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  29.41 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  31.67 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  30.85 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  30.21 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.58 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.4 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.34 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  31.67 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.4 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.61 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  29.26 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.14 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  28.5 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  30.32 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  25.74 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  28.48 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  30.53 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  31.28 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  28.65 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.17 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>