More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0597 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  55.1 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 147 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 151 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 159 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  45.71 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  44.85 
 
 		 148 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 171 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.79 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 149 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  43.59 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.62 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.21 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.79 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  42.41 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  33.71 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 146 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 152 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.96 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  34.01 
 
 		 148 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 152 aa  95.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  35.43 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 151 aa  95.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  36.99 
 
 		 148 aa  94.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 152 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 170 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 149 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 148 aa  94  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 149 aa  94.4  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  42.68 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  42.68 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  37.96 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  35 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  36.57 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.91 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.83 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  42.04 
 
 		 150 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  36.48 
 
 		 204 aa  91.3  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  91.3  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.16 
 
 		 150 aa  91.3  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  36.26 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>