More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0595 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  62.39 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  58.97 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  61.32 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  57.5 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  54.72 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  55.66 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  57.69 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  33.08 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  38.82 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  35.65 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  32.74 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  33.58 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.19 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  38.04 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  39 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  33.02 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  34.78 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  32.46 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>