36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0545 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1439    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  35.14 
 
 		 460 aa  160  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  27.03 
 
 		 454 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2173  hypothetical protein  46.4 
 
 		 177 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11275  normal  0.026924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  24.11 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  25.13 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1148  hypothetical protein  29.78 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00179115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  26.79 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1460  type I restriction-modification system, S subunit, putative  21.01 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20390  hypothetical protein  26.61 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.123185  normal  0.078354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  28.37 
 
 		 411 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.49 
 
 		 401 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  28.89 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  23.36 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  23.36 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.53 
 
 		 423 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25.77 
 
 		 417 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  28.03 
 
 		 405 aa  50.8  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  24.77 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  24.29 
 
 		 409 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  24.29 
 
 		 409 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  27.41 
 
 		 419 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3189  hypothetical protein  27.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.82 
 
 		 441 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  22.3 
 
 		 1362 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  25.41 
 
 		 587 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 		 612 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2785  type I restriction enzyme EcoR124II specificity protein  27.62 
 
 		 121 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.302167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  25.81 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0733  putative DNA methylase-type I restriction-modification system  32.94 
 
 		 110 aa  44.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  32.89 
 
 		 547 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  25.47 
 
 		 555 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.54 
 
 		 456 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24 
 
 		 730 aa  44.3  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.2 
 
 		 528 aa  43.9  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>