14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0506 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  100 
 
 
736 aa  1521    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  84.87 
 
 
1706 aa  1168    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  23.31 
 
 
994 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1837  hemagglutinin protein HagA  47.25 
 
 
2105 aa  79.7  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  24.62 
 
 
1017 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  22.2 
 
 
884 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  23.99 
 
 
1123 aa  64.3  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  22.59 
 
 
1011 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  20.52 
 
 
882 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1326  hemagglutinin, putative  34.21 
 
 
352 aa  57.8  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  23.3 
 
 
1134 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  21.16 
 
 
1110 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0182  hypothetical protein  22.79 
 
 
1440 aa  46.6  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0410  hypothetical protein  20.79 
 
 
1294 aa  45.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>